لاک‌پشت‌های نینجا با بزرگترین چالش خود مواجه می‌شوند که یک غریبه مرموز از آینده با یک هشدار وحشتناک وارد می‌شود. لئوناردو مجبور می‌شود تا برخاسته و برادرانش رافائل، داناتلو و مایکل‌آنجلو را در نبردی رهبری کند تا جهان را از کرانگ، یک گونه بیگانه وحشتناک نجات دهد...
